En el año 1823, antes del cambio de gobierno, que le suscitó nuevos disgustos, uno de sus inferiores subalternos logró sorprender la buena fe del general Espoz y Mina, arrancándole á su favor los honores de archivero de la Corona de Aragón, y desluciendo con ello el decoro de su jefe. Pero éste se presentó al general con las llaves del archivo y su título y el de todos los demás subalternos, diciéndole que después de lo ocurrido, el pundonor no les permitía continuar en sus puestos. Sorprendido quedó el general de la entereza de Bofarull, y al siguiente día le mandó llamar, y rasgando el escrito en que había concedido los honores de archivero al subalterno, devolvióle los títulos y las llaves, rogándole que volviese tranquilo á su establecimiento, y haciéndole presente que nadie está más expuesto á ser sorprendido que las personas contituídas en grandes dignidades.
Como era natural, le aguardaban desazones del mismo género, aunque motivadas con otros pretextos y por otras personas, después de la caída del sistema constitucional. En los últimos tiempos en que éste regía, llevado de su amor á los documentos históricos y de la obligación en que le constituía su cargo, de acuerdo con el respetable monje, su amigo, de quien más adelante hablaremos, solicitó, obtuvo y realizó la traslación de las amenazadas escrituras y códices del monasterio de Ripoll al archivo general. Este servicio á la orden, que tal fué considerado por la mayoría de los monjes, le valió las amenazas y diatribas de alguno de aquellos hombres apasionados que confunden la imprudencia con el celo. Bofarull se disponía á contestar con grande entereza á las acusaciones que, según fundadamente creía, le amagaban, pero su buena fama pudo más que las asechanzas de sus enemigos. Contábase entre estos un oficial del archivo, cuya traslación, contra su natural benignidad y tolerancia y por razones poderosas, se vió obligado á pedir al Gobierno, el cual le calumnió de tal manera en varias representaciones y anónimos dirigidos
