Triunfante el señor Ríos, integró su primer Gabinete con dos liberales pertenecientes al sector que lo había acompañado en su candidatura: los señores Ernesto Barros Jarpa y Benjamín Matte Larrain, en las carteras de Relaciones Exteriores y Hacienda, respectivamente. Las fracciones disidentes se reintegraron casi de inmediato al Partido sin que se produjeran mayores incidencias. Posteriormente, en Setiembre de 1943, integraron el Gabinete que el señor Ríos formó en esa fecha, como representantes oficiales del Partido, los señores Arturo Matte Larrain y Osvaldo Vial Vial, como Ministros de Hacienda y Tierras y Colonización, respectivamente. Estos Ministros permanecieron en funciones hasta Octubre de 1944.
En Diciembre de 1944 se produjo una escisión de carácter regional dentro del Partido, organizándose en Angol el "Partido Liberal Progresista" (Véase) que más tarde habría de reintegrarse al Partido.
En 1944, en elecciones extraordinarias para elegir Senador por la Agrupación de Curicó, Talca, Linares y Maule, el Partido Liberal hizo triunfar la candidatura de don Arturo Alessandri Palma. En las elecciones ordinarias de 1945, eligió 34 diputados. Presidentes del Partido durante esta época fueron los señores Gregorio Amunátegui, Pedro Opaso Letelier, José Maza, Fernando Alessandri, Francisco Bulnes, Máximo Valdés.
Para las elecciones presidenciales de 1946, el Partido Liberal participó en Convención Presidencial con los Partidos Conservador y Agrario Laborista. Tres miembros de sus filas figuraron como candidatos en ella: los señores Arturo Alessandri Palma, José Maza Fernández y Francisco Bulnes Correa. Ante el fracaso de la Convención, el Partido proclamó la candidatura presidencial de don Arturo Alessandri Palma e inició con ella los trabajos electorales.
Posteriormente se realizaron gestiones transaccionales de las cuales resultaron el retiro de la candidatura de don Arturo Alessandri y de la de don Alfredo Duhalde, designándose como candidato de transacción al senador liberal don Fernando Alessandri Rodriguez. Tal cesidión fué aprobada por la Junta Ejecutiva Liberal el 11 de Agosto de 1946.
Don Fernando Alessandri afrontó la campaña electoral con el apoyo del Partido Liberal y de los Partidos Radical Democrático, Agrario Laborista, Democrático, Socialista Auténtico, Liberal Progresista, y otros grupos. Sus contendores fueron don Gabriel González Videla, candidato de la izquierda y don Eduardo Cruz Coke, candidato del Partido Conservador. El resul
